São Francisco tem muito para admirar em termos de beleza e usufruto da Natureza. Com uma localização privilegiada oferece vistas cénicas sobre o Rio Tejo, as Salinas e a Reserva Natural do Tejo em geral.
Na Freguesia encontramos bastante Fauna e Flora que vale a pena descobrir. Destaque para as inúmeras espécies de aves, que inclusive dão o nome a muitas das ruas da Freguesia.
Vale a pena percorrer a pé os vários trilhos e caminhos por entre as zonas mais rurais, sendo que mensalmente a Junta de Freguesia organiza Caminhadas abertas a toda a população!